После той страшной битвы между тьмой и светом, в лице организаций Миллениум и Хэллсинг, многое изменилось. Не изменными остались лишь человеческие желания и амбиции. Английское правительство в лице премьер-министра решило замять это дело, а для этого было необходимо выслать очевидцев и ликвидировать все данные о том, что английское правительство имело хоть какое-то отношение к организации Хэллсинг.
Особняк Хэллсинг взрывают, а то что не успевают уничтожить оставляют таким как есть, теперь это просто еще одно разрущенное здание.
Леди Интегру тайно вывезли из страны и заточили в тюрьму Алькатрас, самую охраняемую американскую тюрьму, а вампиршу заточили в исследовательскую лабораторию, которая располагается под городком "Ракун сити". На ее днк надеются все правящие верхушки стран, ведь если ее особенности можно будет использовать на пользу сильным мира сего, то они или сами станут сверхлюдьми или смогут использовать ее как идеальную "машину убийства", если смогут контролировать ее. Тем временем английские власти находят тело"Зорин Блиц", ее так же помещают в ту же самую лабораторию. Исследования продолжаются... Обе пациентки находятся в сотоянии комы, но что если однажды они выйдут из него?
Тем временем Пип Бернадотте, ставший вампиром, встречает Уолтера, которому тоже удалось уцелеть, они решают найти леди Интегру и освободить ее. Они начинают свои поиски с бывшего шатаба "Хэллсинга".
Что касается Ватикана, то их служащие пошли на поправку через пару месяцев. 13 отдел был расформирован. Теперь сотрудникам данного отдела лучше "не светится", при массовой "охоте на ведьм". Их просто заточили в тюрьмы, чтобы те не сказали некоторые "грязные секреты Ватикана".
"Охота на ведьм" теперь весьма популярна среди обывателей, после "удачных" кадров журналистов, весь мир узнал что некоторые популярные политические лидеры сотрудничают с нежитью. И что эта самая "нежить" отнюдь не фантазия больного воображения. Людям свойственно уничтожать все не объяснимое, а хорошее оно или плохое не важно, на том свете разберутся. Чтобы замять свою причастность к "нежити" политические лидеры свалили вину на некоторых бедняг из своей же среды и обвинив их в сношениях с тьмой, уничтожили. Ныне любой человек, ведущий себя не так, как остальные был под подозрением. Народ жаждал убийств, кажется времена средневековья вернулись, изменились только декорации и способы борьбы. Правительство использует страх народа в своих целях.
Что касается "Миллениума", то после того, как Док всех восстановил, им не осталось места в этом мире. Майор по прежнему хочет сразиться с Алукардом, он не верит в его гибель. Но теперь в этом мире нельзя действовать открыто, теперь не "нечисть" управляет сильными мира сего. У правительства больше нет сдерживающих факторов, оно действует так как ему захочется. Узнав, что фроляйн Зорин Блиц вынуждена находится в весьма затруднительном положении Майор приказывает освободить ее и навести страх на людишек, новым "сюрпризом от Дока" - "вирусом Т". Пусть часть народа станет зомби, а уцелевшие перестанут "охотиться за нечистью". Новая война гораздо интереснее, теперь новый вид "фрики и вампиры" могут быть главными в нем, а человечество станет их рабами. К тому же под знамена можно будет привлечь гораздо больше "разумных вампиров" и не только, ведь есть уже пострадавшие от нового "мирового режима"...